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PCR实验室中,这些PCR常见问题你有遇到过吗?

在PCR实验室进行相关实验操作的时候,总会出现各种各样的问题,比如以下这些!


PCR实验室PCR常见问题一、无扩增条带


可能的原因:

  • 酶失活或在反应体系中未加入酶。失活更换新酶或用另一来源的酶即可解决。

  • 模板含有杂质。比如固定及石蜡包埋的组织就含有甲酸,这样就很有可能造成DNA脱嘌呤而影响PCR的结果,所以我们要先去除模板的杂质。

  • 变性温度不准确。过高酶失活;过低则模板变性不彻底。

  • 引物变质失效。

  • 引物错误。可以利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。

  • DNA凝胶和PCR程序的问题。判断是否是因为这个问题导致的,可以在进行DNA凝胶电泳时加入阳性对照进行筛查等等。


PCR实验室PCR常见问题二、PCR产物量过少


可能的原因:

  • 退火温度不合适。

  • DNA模板量太少。这时候可以适当增加DNA模板量。

  • PCR循环数不足。同理,可以适当增加反应循环数。

  • 引物量不足。一样,可以适当增加体系中引物含量。

  • 延伸时间太短。以1kb/分钟的原则设置延伸时间。

  • 变性时间过长。

  • DNA模板中存在抑制剂等等。


PCR实验室PCR常见问题三、扩增产物在凝胶中涂布或成片状条带弥散


可能的原因:

  • 酶量过高。减少酶量;酶的质量差,调换另一来源的酶。

  • dNTP浓度过高。减少dNTP的浓度。

  • MgCl2浓度过高。可适当降低其用量。

  • 模板量过多。

  • 引物浓度不够优化。可与对引物进行梯度稀释重复PCR反应。

  • 退火温度过低。

  • 电泳体系有问题:凝胶中缓冲液和电泳缓冲液浓度相差太大;凝胶没有凝固好;琼脂糖质量差。

  • PCR试剂盒有问题:运输储存不当引起试剂盒失效;试剂盒本身质量问题,如引物选择、循环参数等选择不当等等。


PCR实验室PCR常见问题四、扩增产物出现多条带 (杂带)


可能的原因:

  • 引物用量偏大,引物的特异性不高。可以调换引物或降低引物的使用量。

  • 循环的次数过多。适当增加模板的量,减少循环次数。

  • 酶的用量偏高或酶的质量不好,可以降低酶量或调换另一来源的酶。

  • 退火温度偏低,退火及延伸时间偏长。

  • 若为PCR试剂盒,也可能时试剂盒本身质量有问题。

  • 反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。

  • 引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。

  • 引物量过多。减少反应体系中引物的用量。

  • 模板量过多。

  • 外源DNA污染等等。


以上就是PCR实验室PCR我们常见的问题了,造成这问题出现的原因也做了详细的解释说明,还有任何疑问的,可直接咨询长沙生物实验室慧登生物客服,24小时在线免费咨询!




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