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微生物病原检测,选择mNGS还是tNGS?mNGS(Metagenomic NGS),即宏基因组测序,又称环境基因组学或群落基因组学,是一种研究微生物群落基因组的先进方法。该技术直接从样本中提取微生物的全部DNA/RNA,并通过高通量测序对其进行分析,以揭示微生物群落的基因组组成和功能。 长沙医学检验实验室慧登生物提醒,与传统方法不同,mNGS无需对微生物进行分离和培养,因此能够更全面地揭示微生物群落的结构与功能。其特别适用于急危重症和疑难感染的诊断,能够显著提高病原体的检出率,尤其对于罕见和特殊病原体更为有效。 mNGS优势: 1、标本检测类型多,无需对微生物进行分离培养,直接提取微生物群落总DNA; 2、范围广,可同时鉴定几乎所有的微生物种类; 3、信息分析全面,除了对物种信息挖掘,还能得到群落表达的重要基因信息等; 4、可快速,高效,大样本的对群落进行分析。 长沙医学检验实验室慧登生物提醒:在涉及真核宿主(如人类痰液、环境灰尘)的样本中,宿主DNA占比高可能严重影响微生物测序深度与分析准确性。因此,在测序前,长沙医学检验实验室慧登生物建议进行宿主DNA去除,以富集目标微生物基因组,确保后续研究的可靠性与灵敏度。 tNGS(Targeted NGS),即靶向高通量测序技术,是一种针对特定基因或基因组区域进行富集与测序的技术。该技术通过聚焦于几十至数百种已知病原微生物及其相关基因,显著提高检测灵敏度,并有效降低宿主核酸的干扰。 目前,tNGS主要依赖两种富集策略: PCR扩增子富集:利用特异性引物对目标片段进行扩增,适用于病毒等小基因组病原体的检测; 杂交探针富集:设计与病原体序列互补的RNA/DNA探针,通过杂交捕获全面覆盖目标基因组区域,长沙医学检验实验室慧登生物提醒,这个适用于更广泛的病原体检测。 tNGS优势: 1、特异性的对感兴趣的病原微生物进行捕获富集,尤其适用于难培养病毒的检测; 2、当宿主基因组高时,tNGS能够极大提高检测灵敏度; 3、只对感兴趣的基因序列测序,成本更低; 目前,长沙医学检验实验室慧登生物就可以进行微生物病原检测!有任何疑问,欢迎随时和客服老师联系~ |
